Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArxO35085 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ArxO35085 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArxO35085 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArxO35085 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArxO35085 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArxO35085 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArxO35085 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArxO35085 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArxO35085 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArxO35085 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArxO35085 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArxO35085 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ArxO35085 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArxO35085 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArxO35085 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArxO35085 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArxO35085 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArxO35085 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ArxO35085 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArxO35085 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArxO35085 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArxO35085 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArxO35085 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArxO35085 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ArxO35085 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ArxO35085 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ArxO35085 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ArxO35085 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArxO35085 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArxO35085 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArxO35085 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArxO35085 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArxO35085 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArxO35085 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArxO35085 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArxO35085 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms