Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4dO09126 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms