Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NumblO08919 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NumblO08919 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NumblO08919 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NumblO08919 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NumblO08919 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NumblO08919 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NumblO08919 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NumblO08919 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NumblO08919 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NumblO08919 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NumblO08919 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NumblO08919 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NumblO08919 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NumblO08919 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NumblO08919 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NumblO08919 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NumblO08919 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NumblO08919 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NumblO08919 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NumblO08919 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NumblO08919 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NumblO08919 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms