Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcof1O08784 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcof1O08784 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms