Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp2O08574 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp2O08574 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms