Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d1O08532 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms