Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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Usp35M0QWN7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp35M0QWN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms