Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3488M0QW81 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms