Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8050L7N2E3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms