Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3278L7N2D2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3278L7N2D2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3278L7N2D2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3278L7N2D2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3278L7N2D2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3278L7N2D2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3278L7N2D2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3278L7N2D2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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