Protein–RNA interactions for Protein: L7N296

Gm3739, Predicted gene 3739, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3739L7N296 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3739L7N296 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3739L7N296 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3739L7N296 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3739L7N296 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3739L7N296 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms