Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r80L7N1Z3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms