Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm379J3QQ19 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Gm379J3QQ19 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm379J3QQ19 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm379J3QQ19 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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