Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2056J3QQ02 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms