Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700122O11RikJ3QPW6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700122O11RikJ3QPW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700122O11RikJ3QPW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms