Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8298J3QPI0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms