Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp408H7BX78 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms