Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm29394H3BIW7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm29394H3BIW7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms