Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tubgcp6G5E8P0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubgcp6G5E8P0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tubgcp6G5E8P0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms