Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r12G5E8G1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r12G5E8G1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms