Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r34G3XA52 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms