Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a3G3X939 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms