Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700067P10RikG3X8U2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms