Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx1-1G3UXB3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-1G3UXB3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms