Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp72F8VQC1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms