Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms