Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Farp1F8VPU2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms