Protein–RNA interactions for Protein: F7BY56

Gm8138, Predicted gene 8138 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8138F7BY56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8138F7BY56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8138F7BY56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms