Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh11xF6ZNL5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdh11xF6ZNL5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms