Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21970F6XX07 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21970F6XX07 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms