Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10722F6VLK5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10722F6VLK5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms