Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sptbn5F6UCX4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms