Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngap1F6SEU4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms