Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc74aE9Q9U8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms