Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm5407E9Q7Q1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Gm5407E9Q7Q1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Gm5407E9Q7Q1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Gm5407E9Q7Q1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5407E9Q7Q1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Gm5407E9Q7Q1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms