Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Simc1E9Q6E9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Simc1E9Q6E9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 701.2 ms