Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtproE9Q612 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtproE9Q612 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms