Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FancfE9Q5Z5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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