Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nolc1E9Q5C9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nolc1E9Q5C9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms