Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms