Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdr17E9Q271 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Wdr17E9Q271 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms