Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc171E9Q1U1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc171E9Q1U1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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