Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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