Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3095E9Q058 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3095E9Q058 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm3095E9Q058 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms