Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Scaf11E9PZM7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scaf11E9PZM7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms