Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd2E9PZM4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chd2E9PZM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms