Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ift140E9PY46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ift140E9PY46 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ift140E9PY46 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms