Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim5E9PV98 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms