Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifit3bE9PV48 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifit3bE9PV48 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifit3bE9PV48 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms