Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8994E9PV04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8994E9PV04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8994E9PV04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8994E9PV04 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8994E9PV04 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8994E9PV04 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm8994E9PV04 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8994E9PV04 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8994E9PV04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms